MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL5

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012000	CTAAA	2	10	29	38	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012000	TAA	2	6	81	86	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012000	ATT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012000	ATA	2	6	125	130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012000	TCT	2	6	135	140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012000	T	7	7	216	222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012000	AAT	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012000	ATTA	2	8	336	343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012000	TA	3	6	381	386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012000	AAT	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012000	TCT	2	6	427	432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012000	AAT	2	6	448	453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012000	TG	3	6	484	489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012000	A	6	6	511	516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012000	T	7	7	543	549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012000	AAT	2	6	582	587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012000	T	6	6	656	661	0 %	100 %	0 %	0 %	222143326
18	NC_012000	TATT	2	8	791	798	25 %	75 %	0 %	0 %	222143326
19	NC_012000	T	6	6	797	802	0 %	100 %	0 %	0 %	222143326
20	NC_012000	TTC	2	6	832	837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
21	NC_012000	AAT	2	6	933	938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
22	NC_012000	T	6	6	1024	1029	0 %	100 %	0 %	0 %	222143326
23	NC_012000	TAA	2	6	1041	1046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
24	NC_012000	A	6	6	1104	1109	100 %	0 %	0 %	0 %	222143326
25	NC_012000	ATA	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
26	NC_012000	TCAAAA	2	12	1163	1174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222143326
27	NC_012000	AATCT	2	10	1179	1188	40 %	40 %	0 %	20 %	222143326
28	NC_012000	CAT	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143326
29	NC_012000	ATG	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143326
30	NC_012000	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
31	NC_012000	TTA	2	6	1259	1264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143326
32	NC_012000	AT	3	6	1374	1379	50 %	50 %	0 %	0 %	222143326
33	NC_012000	TTA	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143326
34	NC_012000	CAA	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143326
35	NC_012000	ATA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143326
36	NC_012000	TTTTCC	2	12	1553	1564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
37	NC_012000	TCT	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143326
38	NC_012000	T	6	6	1594	1599	0 %	100 %	0 %	0 %	222143326
39	NC_012000	A	6	6	1606	1611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012000	AAG	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012000	AT	4	8	1649	1656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012000	GAA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012000	A	7	7	1707	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012000	CTT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012000	T	7	7	1778	1784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012000	T	7	7	1786	1792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012000	T	7	7	1846	1852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012000	T	6	6	1866	1871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012000	ACT	3	9	1918	1926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012000	TCT	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012000	TTC	2	6	1972	1977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012000	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012000	TTTA	2	8	2007	2014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012000	ATAA	2	8	2124	2131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012000	AAAT	2	8	2204	2211	75 %	25 %	0 %	0 %	222143327
56	NC_012000	TA	3	6	2226	2231	50 %	50 %	0 %	0 %	222143327
57	NC_012000	TGCT	2	8	2291	2298	0 %	50 %	25 %	25 %	222143327
58	NC_012000	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143327
59	NC_012000	AAT	2	6	2407	2412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143327
60	NC_012000	T	6	6	2423	2428	0 %	100 %	0 %	0 %	222143327
61	NC_012000	GAAT	2	8	2467	2474	50 %	25 %	25 %	0 %	222143327
62	NC_012000	TTC	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
63	NC_012000	TCT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
64	NC_012000	T	6	6	2580	2585	0 %	100 %	0 %	0 %	222143327
65	NC_012000	TCC	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143327
66	NC_012000	GTC	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143327
67	NC_012000	TC	3	6	2650	2655	0 %	50 %	0 %	50 %	222143327
68	NC_012000	TGT	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143327
69	NC_012000	AT	4	8	2681	2688	50 %	50 %	0 %	0 %	222143327
70	NC_012000	TTA	2	6	2690	2695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143327
71	NC_012000	TTGTT	2	10	2701	2710	0 %	80 %	20 %	0 %	222143327
72	NC_012000	TTC	2	6	2727	2732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
73	NC_012000	TCT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
74	NC_012000	TTC	3	9	2812	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143327
75	NC_012000	T	6	6	2905	2910	0 %	100 %	0 %	0 %	222143328
76	NC_012000	TCT	2	6	2912	2917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
77	NC_012000	TACGT	2	10	2930	2939	20 %	40 %	20 %	20 %	222143328
78	NC_012000	TTC	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
79	NC_012000	TTC	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
80	NC_012000	TATC	2	8	3072	3079	25 %	50 %	0 %	25 %	222143328
81	NC_012000	TGTTC	2	10	3081	3090	0 %	60 %	20 %	20 %	222143328
82	NC_012000	TGA	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143328
83	NC_012000	TTC	2	6	3142	3147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
84	NC_012000	T	6	6	3167	3172	0 %	100 %	0 %	0 %	222143328
85	NC_012000	GTT	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
86	NC_012000	TTTG	2	8	3190	3197	0 %	75 %	25 %	0 %	222143328
87	NC_012000	TTG	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
88	NC_012000	TAA	3	9	3234	3242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143328
89	NC_012000	TGTGAT	2	12	3243	3254	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222143328
90	NC_012000	T	7	7	3306	3312	0 %	100 %	0 %	0 %	222143328
91	NC_012000	T	6	6	3474	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	222143328
92	NC_012000	TTC	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143328
93	NC_012000	TAAT	2	8	3500	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	222143328
94	NC_012000	GTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143328
95	NC_012000	CAT	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143329
96	NC_012000	TCT	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143329
97	NC_012000	TAC	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143329
98	NC_012000	TCAC	2	8	3832	3839	25 %	25 %	0 %	50 %	222143329
99	NC_012000	GTTC	2	8	3923	3930	0 %	50 %	25 %	25 %	222143329
100	NC_012000	CAC	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_012000	TATAA	2	10	3983	3992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012000	CGT	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012000	A	6	6	4111	4116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012000	TCAAAA	2	12	4158	4169	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012000	TAA	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012000	AATT	2	8	4201	4208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012000	ATT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012000	T	7	7	4240	4246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012000	ACTT	2	8	4278	4285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012000	AAT	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012000	AAT	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012000	CAA	2	6	4312	4317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.